T{0}}کتابخانه کوتاه شده سلولی|T{1}}محلی سازی دقیق اپی توپ سلولی|غربالگری حداقل اپی توپ|کتابخانه پپتید ایمنی|علم{2}}پپتید

 

توضیحات صفحه (توضیحات متا)

 

آیا به مکان‌یابی دقیق حداقل توالی هسته اپی‌توپ‌های T{0}} نیاز دارید؟ Science-پپتید خدمات حرفه‌ای سنتز کتابخانه‌های کوتاه‌شده T- را ارائه می‌کند که از انتهای N، C-یا هر دو انتها گام به گام کوتاه می‌شود، با تحویل سریع برای پشتیبانی از تحقیقات ایمنی سلول T{{5}. به پرس و جو خوش آمدید.

 

T{0}}تحقیق اپی توپ سلولی: یافتن کوتاهترین آنها اغلب بسیار مهم است

 

کتابخانه کوتاه سلول T- چیست؟
کسانی که تحقیقات ایمنی سلولی- را انجام می دهند می دانند که غربالگری یک پپتید مثبت تنها اولین قدم است. سوال بعدی این است: آیا کل پپتید یا فقط یک بخش کوچک واقعا توسط سلول های T شناسایی می شود؟

کتابخانه T{0}} سلول کوتاه شده برای پاسخ به این سوال استفاده می شود. با شروع پپتید طولانی مثبت به دست آمده از غربالگری اولیه، اسیدهای آمینه گام به گام از انتهای N، C- یا هر دو انتها جدا می‌شوند و مجموعه‌ای از پپتیدهای کوتاه‌تر را ایجاد می‌کنند. سپس، آزمایش‌های تابع سلول T برای آزمایش هر یک استفاده می‌شود تا زمانی که «کوتاه‌ترین نسخه» که هنوز می‌تواند سلول‌های T را فعال کند، پیدا شود.

این کوتاه ترین نسخه اپی توپ هسته ای است که سلول های T در واقع آن را تشخیص می دهند.


چرا کوتاه کردن؟

  • محلی سازی دقیق: شناسایی توالی هسته برای ارائه مولکول MHC و تشخیص TCR
  • تحقیق مکانیزم: درک الزامات مرزی پردازش و ارائه اپی توپ
  • بهینه‌سازی واکسن: طراحی واکسن‌هایی با کوتاه‌ترین توالی‌های مؤثر برای جلوگیری از تداخل توالی‌های نامربوط
  • توسعه تشخیصی: بهبود ویژگی معرف های تشخیص
page-800-600

 

چه کاری می توانیم انجام دهیم؟

 

1. روش های برش چندگانه برای پوشش نیازهای تحقیقاتی مختلف

روش های برش

توضیح

سناریوهای قابل اجرا

N-قطع پایانه

اسیدهای آمینه را یکی یکی از انتهای N- جدا کنید

N{0}}مرز پایانه را تعیین کنید

C{0}}قطع پایانه

اسیدهای آمینه را یکی یکی از انتهای C- جدا کنید

مرز پایانه C-را تعیین کنید

برش در هر دو انتها

برش همزمان در هر دو انتها

محدود کردن سریع محدوده برای محلی سازی دقیق

برش اندازه گام نابرابر

بزرگ-ابتدا غربالگری درشت مرحله، سپس دقیق-محلی سازی دقیق مرحله

غربالگری اولیه پپتیدهای طولانی، صرفه جویی در زمان و هزینه

 

2. طراحی کتابخانه: از پپتیدهای مثبت تا اپی توپ های حداقل

پارامترها

توضیح

طول پپتید والدین

معمولاً 8-25 اسید آمینه (طول معمول برای غربالگری اپی توپ سلول T)

روش های برش

N-پایانه، C-پایانه، یا هر دو

اندازه مرحله برش

به طور کلی، 1 اسید آمینه را در یک زمان کوتاه کنید یا با مراحل بزرگ و سپس مراحل کوچکتر شروع کنید

حداقل طول

معمولاً 5-9 اسید آمینه (اپی توپ های کلاس I MHC) یا 9-15 (اپی توپ های کلاس II MHC) حفظ می شوند.

کنترل پپتید

توالی پپتید والد (کنترل مثبت)، پپتید نامربوط (کنترل منفی)

 

مثال: یک پپتید مثبت با 15 اسید آمینه که از غربالگری اولیه به دست می‌آید، و می‌خواهیم برش N{1}}ترمینال را برای تعیین کوچک‌ترین اپی توپ انجام دهیم.
اپی توپ 1: برداشتن موقعیت اول (14 متر)
Epitope 2: دو موقعیت اول را بردارید (13mer)
اپی توپ 3: سه موقعیت اول را بردارید (12 متر)
تا زمانی که 5-6 اسید آمینه حفظ شود

 

3. ظرفیت مصنوعی

پروژه

ظرفیت

طول پپتید

5-25 اسید آمینه (پس از برش)

اندازه کتابخانه

10-50 پپتید (بسته به طول پپتید اصلی و روش برش)

گزینه های خلوص

خام (70-85%)، خلوص معمولی (85-95%)، خلوص بالا (95-98%)

بازده در هر پپتید

0.5-5 میلی گرم (معمولاً برای آزمایش سلول T کافی است)

روش تحویل

صفحه 96 چاهی، لوله سانتریفیوژ تک، ویال

چرخه

2-3 هفته برای حداکثر 20 پپتید

 

4. کنترل کیفیت: داده های موجود برای هر پپتید

ما همه پپتیدهای موجود در کتابخانه T{0}}قطع شده را ارائه می‌کنیم:

طیف سنجی جرمی MS: وزن مولکولی صحیح را تایید می کند

خلوص HPLC: داده های خلوص برای محصولات خام یا خالص شده

گزارش COA: یک گزارش برای هر پپتید، قابل جستجو بر اساس طول یا روش برش

 

خدمات اختیاری:

تعیین محتوای پپتید: برای تعیین کمیت دقیق، این امکان وجود دارد

تست حلالیت: حلال های مناسب توصیه شده (DMSO، PBS و غیره)

تشخیص اندوتوکسین: در آزمایشات سلولی استفاده می شود و از عدم تداخل اطمینان حاصل می کند

 

چرا ما را برای کتابخانه T{0}} سلول کوتاه شده خود انتخاب کنید؟

 

1. ما 20 سال است که این کار را انجام می دهیم
کتابخانه کوتاه‌شده سلولی AT-به نظر می‌رسد «مجموعه‌ای از پپتیدهای کوتاه‌تر» است، اما اطمینان از درستی، خلوص کافی و تحویل به موقع هر پپتید شامل جزئیات زیادی است. در طول سال‌ها، ما به مشتریان کمک کرده‌ایم کتابخانه‌های کوتاه‌شده مختلفی بسازند، از MHC کلاس I تا MHC کلاس II، از موش گرفته تا انسان، و این فرآیند در حال حاضر به خوبی-تثبیت شده است.

 

2. روش های برش انعطاف پذیر، طراحی آزمایشی شما را درک می کند
برخی از شرکت‌ها فقط می‌دانند که چگونه یک انتها را کوتاه کنند، و وقتی سعی می‌کنند روش را تغییر دهند، بی‌اطلاع هستند. ما متفاوت هستیم:
N{0}}برق پایانه: رویه استاندارد
C{0}}قطع پایانه: به همان اندازه مسلط است
کوتاه کردن در هر دو انتها: امکان طراحی کتابخانه های ترکیبی را فراهم می کند
کوتاه کردن دو مرحله‌ای: ابتدا، یک-غربالگری درشت در مقیاس بزرگ (هر بار برش 2-3 قطعه)، سپس موقعیت‌یابی دقیق-بعد از یافتن محدوده فعالیت، صرفه‌جویی در هزینه و زمان

 

3. طهارت در حد نیاز، پرهیز از هزینه های غیر ضروری
آزمایش‌های سلول T نیازمند خلوص خاصی هستند، اما بالاتر همیشه بهتر نیست.
محصول خام (70-85%): برای غربالگری اولیه استفاده می شود، ابتدا بررسی می شود که کدام طول ها هنوز فعالیت دارند و در هزینه صرفه جویی می شود.
خلوص معمولی (85-95%): مناسب برای اکثر آزمایشات سلول T (ELISPOT، ICS)، مقرون به صرفه.
خلوص بالا (95-98%): نیاز به کمی سازی دقیق یا مطالعات ساختاری دارد که منجر به نتایج پایدارتر می شود.

 

4. داده های کامل، بدون نگرانی در مورد انتشار
من داده های MS و HPLC را برای هر پپتید که در اکسل سازماندهی شده است، ارائه کرده ام. این به وضوح نشان می دهد که کدام پپتید با چه طولی مطابقت دارد، خلوص آن و اینکه آیا وزن مولکولی صحیح است یا خیر. شما می توانید اطلاعات تکمیلی را بدون نیاز به سازماندهی خود در مقاله خود بگنجانید.

 

5. آیا نیاز به کنترل اندوتوکسین دارید؟ ما می توانیم آن را انجام دهیم
آزمایشات سلول T به اندوتوکسین ها حساس هستند. ما می‌توانیم خدمات تست اندوتوکسین را برای اطمینان از اینکه سطح اندوتوکسین هر پپتید کمتر از 0.1 EU/mg است ارائه دهیم، که بر عملکرد سلول تأثیر نمی‌گذارد.

 

6. از غربالگری تا اعتبارسنجی، ما شما را در تمام مسیر دنبال می کنیم
پس از یافتن حداقل اپی توپ، کارهای بعدی اغلب مورد نیاز است: مانند سنتز تترامرهای MHC، انجام مطالعات ساختاری، و توسعه گیرنده‌های سلولی-. علوم{3}}پپتید می‌تواند به طور یکپارچه این مراحل را-همان پروژه، همان فرد مخاطب، بدون نیاز به تنظیم مجدد، به هم متصل کند.

 

کتابخانه کوتاه T{0}}سلول اپی توپ کجا استفاده می شود؟

 

حوزه های تحقیقاتی

برنامه های کاربردی

روش های کوتاه کردن توصیه شده

ایمنی عفونت

برای شناسایی حداقل اپی توپ سلول T{0}} آنتی ژن های ویروسی یا باکتریایی

N-ترمینال + C-ترمینال برش

ایمنی تومور

مکان یابی دقیق اپی توپ هسته نئوآنتی ژن ها

برش در هر دو انتها

بیماری های خود ایمنی

برای شناسایی دنباله اصلی برای شناسایی سلول‌های-تواکنشی{1}}خود

N{0}}Tterminal Truncation یا C{1}}Terminal Truncation

توسعه واکسن

طراحی واکسن با استفاده از کوتاه ترین اپی توپ موثر

برش در هر دو انتها

تحقیقات گیرنده سلولی-

حداقل الزامات برای تحقیقات تشخیص TCR

N-ترمینال + C-ترمینال برش

نظارت بر ایمنی

در حال توسعه روش‌های تشخیص اپی توپ-خاص

سنتز پس از تعیین حداقل اپی توپ

 

تحویل و کنترل کیفیت

 

فرمت تحویل:
صفحه 96 چاهی (یک پپتید در هر چاه، پودر لیوفیلیزه، با برچسب روش برش و طول)
یا بسته بندی مجدد لوله سانتریفیوژ جداگانه (در صورت تقاضا)
اطلاعات علامت گذاری: روش برش، طول، توالی، وزن مولکولی، خلوص


اسناد همراه:
جدول خلاصه اکسل (توالی، مگاوات، خلوص، پیوند فایل MS برای همه پپتیدها)
COA فردی (PDF) برای هر پپتید
گزارش خلاصه طراحی کتابخانه (توضیح روش برش و طول هر پپتید)
اختیاری: تشخیص اندوتوکسین، داده های حلالیت، تعیین محتوای پپتید
قبل از ارسال هر کتابخانه کوتاه‌شده سلول T، آن را بررسی می‌کنیم تا مطمئن شویم روش کوتاه‌سازی درست است، عدد پپتید درست است و داده‌ها کامل است.

page-800-1067
page-800-1067
page-800-1067

 

سه مورد واقعی-جهانی

 

مورد 1: پروژه عفونت ویروسی در یک موسسه تحقیقاتی

A client used an overlapping peptide library to screen out a 15-amino acid T-cell epitope and wanted to determine the minimal core sequence. We synthesized N-terminal truncated libraries (from 15mer to 7mer) and C-terminal truncated libraries (from 15mer to 7mer), totaling 18 peptides with a purity >90 درصد مشتری از سنجش ELISPOT استفاده کرد و دریافت که 8 پپتید اسید آمینه در موقعیت های 5-12 همچنان می توانند سلول های T را فعال کنند. هر پپتید کوتاه‌تری بی‌اثر بود، دقیقاً محل اپی توپ هسته.

مورد 2: پروژه نئوآنتی ژن در یک شرکت ایمونولوژی تومور

مشتری یک اپی توپ جهش-به دست آمده از سلول T- از نمونه تومور بیمار، یک پپتید طولانی از 13 اسید آمینه را شناسایی کرد. ما یک استراتژی کوتاه کردن مرحله نابرابر طراحی کردیم: ابتدا یک کتابخانه غربالگری درشت (7 پپتید) با دو پپتید شکافته شده در هر N-پایانه و C- را سنتز کردیم. پس از یافتن محدوده فعالیت، یک کتابخانه محلی سازی دقیق (6 پپتید) با یک پپتید در هر مرحله در نزدیکی مرز فعالیت شکافته شد. دو دسته شامل 13 پپتید در 3 هفته تحویل داده شد. مشتری نتایج را با استفاده از ICS تأیید کرد و در نهایت یک اپی توپ اصلی از 9 اسید آمینه را پیدا کرد.

مورد 3: پروژه تحقیقاتی بیماری خودایمنی

مشتری، در حال تحقیق روی سلول های T خودواکنشی در دیابت نوع 1، یک پپتید مثبت 12-اسید آمینه را شناسایی کرده بود و می خواست اپی توپ اصلی آن را تعیین کند. ما N{6}}کتابخانه‌های کوتاه‌شده انتهایی (12 تا 6 متر) و کتابخانه‌های کوتاه‌شده با ترمینال C (12 تا 6 متر)، که در مجموع 14 پپتید را شامل می‌شد، سنتز کردیم و تشخیص اندوتوکسین را ارائه کردیم.<0.1 EU/mg). The client used T cell proliferation experiments and found that the 8 amino acid peptides at positions 3-10 retained activity; subsequently, tetramer staining was performed using this minimal epitope.

 

بیایید در مورد نیازهای کتابخانه T{0}}سلول کوتاه شده شما صحبت کنیم؟

 

چه نیاز به هدف قرار دادن اپی توپ های ویروسی، نئوآنتی ژن های تومور، یا اهداف خودایمنی داشته باشید، ما می توانیم به شما در طراحی و سنتز کتابخانه های{0}}T{1}} با کیفیت بالا کمک کنیم.


آنچه شما باید به من بگویید:
توالی پپتید والد (پپتیدهای مثبت به دست آمده از غربالگری اولیه)
طول پپتید والد و اطلاعات شناخته شده (نوع MHC و غیره)
روش برش (N-ترمینال، C-ترمینال، یا هر دو انتها)
استراتژی برش (برش یک پپتید در یک زمان یا دو{0}}روش مرحله ای)
حداقل طول نگهداری
مقدار مورد نیاز برای هر پپتید
الزامات خلوص


آیا تشخیص اندوتوکسین لازم است؟
فرمت تحویل (بشقاب یا لوله)


چه زمانی به آن نیاز دارید؟

ما در عرض 24 ساعت به شما یک نقل قول و برنامه تحویل می دهیم.